Mitra BARZINE

Cette thèse intitulé "Investigating normal human gene expression in tissues with high-throughput transcriptomic and proteomic data" traite de la robustesse d'expression des gènes à travers les tissues et les études à partir de données transcriptomiques et protéomiques humaines produites respectivement par séquençage à haut débit (RNA-Seq) et par spéctrométrie de masse ascendante sans étiquette (label-free bottom-up ms).

Dans l'ensemble, de nombreux gènes partagent des profils d'expression similaires entre les deux niveaux biologiques, par exemple, les gènes dont la protéine est détectée dans un seul tissu sont plus susceptibles de voir leur ARNm montrer une spécificité pour le même tissu. En outre, trois groupes de gènes présentent un enrichissement fonctionnel de processus biologiques. Les gènes ayant des expressions de protéines et d'ARNm fortement corrélées entre les tissus sont enrichis dans les processus cataboliques. Les gènes ayant les expressions les plus anti-corrélées sont enrichis pour la régulation des ribosomes et des ARNnc. Les gènes ayant une protéine détectée dans un seul tissu sont enrichis dans les processus de signalisation.

Cette formation, dispensée en deux ans, permet d'acquérir une formation poussée en informatique pour des personnes ayant une formation initiale scientifique autre telle que la Biologie ou dans mon cas la Chimie fine.
La Biologie reste le principal domaine d'applications où ces connaissances informatiques générales sont mises en œuvre. Au delà de ça, des algorithmes et des méthodes spécifiques à la Bioinformatique sont largement traités.
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