Mitra BARZINE
Bioinformaticienne / Chercheure spécialisée en visualisation / analyse de données (PhD)
Situation professionnelle
En fin de contrat
Ouverte aux opportunités
Présentation
Diplômée d'un doctorat de bio-informatique (PhD Life Science obtenu à l'Université de Cambridge (Royaume-Uni) et préparé au sein de l'EMBL-EBI) — obtenu à l'issue d'un Master 2 Bio-informatique et d'un Master 2 professionnel de Chimie Fine et thérapeutique, je suis actuellement en poste au sein de l'Institut Cochin, Paris, France.
Armée de ma formation académique transversale et étant d'un caractère enthousiaste et sociable, j'apprécie d'échanger et de travailler avec des spécialistes de tout domaine afin d'élargir mes horizons.
Armée de ma formation académique transversale et étant d'un caractère enthousiaste et sociable, j'apprécie d'échanger et de travailler avec des spécialistes de tout domaine afin d'élargir mes horizons.
Chercheure contractuelle (postdoctorante) en Bioinformatique
Institut Cochin
Depuis mai 2021
CDD
Paris
- Analyse de données snRNAseq (single nuclei) d'échantillons de placenta et de choriodécidue chez la femme et la souris
- Analyse (in silico) de l'interaction entre les cellules
- Médiation scientifique à travers le dispositif Apprentis Chercheurs
Consultante//Postdoctorante au sein du projet TargetID
Université de Malte
Février 2021
à décembre 2022
Freelance
- Développement et mise en œuvre d'un pipeline d'analyse de RNA-Seq adapté pour une étude de 1000 patients du projet TargetID
(essentiellement: Snakemake/R/bioconductor et bash) - Formation d'étudiants :
- aux pratiques de programmation lettrée
- à l'analyse et interprétation de données RNA-Seq et plus particulièrement dans le cadre d'étude d'expression différentielle.
- aux pratiques de programmation lettrée
Doctorante à L'EMBL-EBI (Predoctoral Fellow)
EMBL (EMBL-EBI)
2013
à 2020
CDD
Cambridge
Royaume-Uni
- Mise en oeuvre des activités de recherche
- Valorisation et diffusion de l'information scientifique et techniques
- Collaboration internationale en enseignement et administrative
- Organisation d'événements scientifiques (pour la communauté scientifique ou pour le général publique)
Ingénieure stagiaire en Bioinformatique
UMR CNRS 6204 - U3B
Mars 2011
à septembre 2011
Stage
Nantes
France
- Comparaison topologique des lipases en vue de comprendre leur énantiosélectivité
Détails de l'expérience
- Développer un plugin pour le logiciel PyMOL afin de permettre cette étude
- Rédaction du cahier des charges
- Création et développement (Python) de la solution
- Création de jeux d'essais
- Analyse et interprétation biologiques des résultats obtenus
- Rédaction de manuel utilisateurs, documentation technique
Description de l'entreprise
Ce stage s'est déroulé au sein de l'unité U3B, UMR CNRS 6204 sous la direction du Pr Vinh TRAN
Site web de l'entreprise
Ingénieure stagiaire en Chimie fine
Bayer Cropscience
Mars 2009
à septembre 2009
Stage
Lyon
France
- Synthèse de composés hétérocycliques à visée phytosanitaire
Détails de l'expérience
- Etablissement de voies de synthèse
- Synthèses de molécules
- Purification et caractérisation de milieux réactionnels
Description de l'entreprise
Ce stage s'est déroulé au sein du centre de Recherche de La Dargoire de Bayer CropScience, sous la direction du Dr David BERNIER.
Site web de l'entreprise
Stagiaire chimie fine
Chelatec SAS
Mars 2008
à septembre 2008
Stage
Nantes
France
- Synthèse de précurseurs stanniques et iodation de molécules biologiques
Détails de l'expérience
- Synthèse de molécules
- Purification et caractérisation de milieux réactionnels
Description de l'entreprise
Ce stage s'est déroulé sous la direction du Dr Julien LEGAL
Site web de l'entreprise
Stagiaire Technicien supérieur
National Herbarium of College of Sciences
Juillet 2007
à août 2007
Stage
Téhéran
Iran
- Isolation and purification of vegetal DNA for PCR reactions
Détails de l'expérience
- Sous la direction du Pr Ahmad GHAHREMAN et du Dr. Farideh ATAR
- Langue parlé : Anglais