Claudine Lamothe
Bioinformaticienne
Situation professionnelle
En fin de contrat
En recherche active
Présentation
Après avoir passé trois ans à travailler dans le domaine des jeux vidéo, je change de carrière pour travailler en bio-informatique. J'aime beaucoup programmer, analyser des données et résoudre des problèmes. J'aimerais développer des applications pour faciliter le traitement de données massives en santé, biologie, écologie, etc.
Bio-informaticienne
CHU de Québec
Juin 2018
à octobre 2018
- Répondre aux demandes des chercheurs de la plateforme de protéomique
- Tester des logiciels d’analyse de données spectrométriques (Specter, DIAUmpire, PECAN, etc)
- Optimiser des scripts R pour un usage plus généralisé et plus robuste
- Créer des scripts Python pour télécharger des données génomiques, protéomiques et transcriptomiques via API
Bio-informaticienne
Cours "Génomique computationnelle", Université Laval, Québec
Janvier 2016
à mai 2016
- Maîtriser les notions de base en lien avec la bio-informatique: alignements, séquençage de nouvelle génération, ChIP-Seq, RNA-Seq, Graphes de de Bruijn, etc.
- Apprendre l'usage des principaux outils de bio-informatique: Bash, BLAST, BWA, samtools, TopHat2, Cufflinks
- Aligner des données génomiques ou transcriptomiques sur des génomes de références
- Annoter des données ChIP-Seq
- Présenter un rapport oral sur l'assembleur de génomes SPAdes
Développeur logiciel
Cours "R pour Scientifiques", Université Laval, Québec
Janvier 2016
à mai 2016
- Concevoir un programme simulant un jeu de mémoire et affichant les résultats de la partie selon un format pré-déterminé
- Compiler un package complet avec documentation
- Apprendre des notions de base d'optimisation de code (vectorisation, calcul en parallèle, benchmarking)
- Debugger le code en utilisant le package testthat
- Créer des graphiques détaillés à partir de jeux de données
Auxiliaire de recherche
Laboratoire Landry
Mai 2015
à septembre 2015
Stage
- Transformer des levures avec des plasmides contenant des gènes modifiés
- Vérifier la présence du gène modifié par PCR
- Envoyer l'ADN amplifié au séquençage
Description de l'entreprise
Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes
Site web de l'entreprise
Auxiliaire de recherche
Laboratoire Martin Beaulieu
Mai 2014
à septembre 2014
Stage
- Effectuer du clonage moléculaire chez E. coli
- Apprendre la microscopie confocale
- Faire des assemblages Gibson
- Extraire et quantifier l'ADN par spectrophotométrie pour l'envoyer au séquençage
- Cultiver des cellules CHO
Description de l'entreprise
Centre de recherche de l'Institut universitaire en santé mentale de Québec
Auxiliaire de recherche
Ministère des Ressources naturelles du Québec
Juin 2013
à août 2013
Stage
- Effectuer une recherche de littérature pour un employé du Ministère
- Marquer des saumons juvéniles à la station piscicole de Tadoussac
Conseillère à la vente
Encadrement Ste-Anne
Septembre 2012
à août 2013
- Conseiller les clients sur les options d'encadrement
- Proposer des encadrements créatifs aux clients
- Préparer les commandes et effectuer le suivi avec les clients
Artiste 2D/3D
Sarbakan
Janvier 2008
à mai 2011
- Modéliser des personnages et environnements 3D
- Créer les interfaces utilisateurs
- Réaliser les ébauches d'écrans de jeux pour clients
Description de l'entreprise
Compagnie de jeux vidéo en ligne et mobiles
