Bastien Gamboa

Please take a look at my website (including my English CV) :
www.alastat.com

Vous trouverez le détail approfondi de chaque expérience, compétence et formation en cliquant dessus

La volonté de réfléchir au jour le jour et d'être confronté à des problèmes n'ayant pas encore de solution m'a amené à m'épanouir dans la Recherche Préclinique.

Ma formation universitaire biologique et écologique est un atout pour discuter avec les scientifiques. Elle m'aide à vulgariser les concepts statistiques et à mieux comprendre les biologistes dans leurs demandes.

CV réalisé sur DoYouBuzz

Expériences

Biostatisticien en Recherche Clinique
Référent biostatistique de la Recherche, mon travail se partage entre la réalisation des analyses statistiques, le choix du design et du sample size, la recherche et/ou création de nouvelles techniques d'analyses, de normalisations...
Intervention dans les études précliniques et cliniques de l'identification de la cible à la Phase IV
Production de rapport statistiques PDF/Word (LaTeX/Rmarkdown et R)
Production d'application dédiée pour les études routinières (tcltk, shiny, R)
Formations statistiques
Données de différentes origines : paramètres physiques (TEWL, poids), morphologique (épaisseur épiderme, nombre de cellules), lipidomique (MSMS), protéomique (Elisa, MS), transcriptomique (Arrays, Sequencing)
Interaction avec des biologistes, scientifiques, techniciens, managers
Référent pour l'interaction avec la Clinique au sujet de ICH, data management... grâce à mes débuts chez Galderma partagés entre la Recherche et la Pré-clinique
Valorisation de mon bagage écologique dans l'analyse du microbiome cutané

Détails de l'expérience

Le poste de biostatisticien au sein de la Recherche était précédemment tenu par un CDD junior partageant son temps entre la Recherche et la Pré-clinique. Mon profil a motivé la création d'un temps plein en CDI.
La statistique en Recherche, par manque de biostatisticien, était réalisée en grande majorité par les techniciens et scientifiques avec peu de bagages statistiques via des logiciels tels que PRISM et ArrayStudio
Depuis mon arrivée chez Galderma la qualité statistique des études Recherche a pu être améliorée dans son ensemble grâce à des formations statistiques, des workflows dédiés à chaque étude routinières, et des conseils ponctuels.
J'analyse les nouvelles études et établis un workflow dédié auquel je forme les équipes.
Des applications dédiées (via R, tcltk, shiny, GeneData ou ArrayStudio) ont été créées pour certaines études routinières afin d'harmoniser les résultats entre les différentes équipes et diminuer le temps d'analyse des données.

Ce poste se partage entre la Recherche (Dermatologie Moléculaire - avant la phase IIa) et l'Early Clinic (phase IIa), une semaine chaque
Apprentissage de l'industrie pharmaceutique:
- Recherche : modèles in vitro, ex vivo et in vivo
- Pré-clinique : premières étude 'efficacy' chez l'Homme respectant les règles ICH
Kick off meeting
Protocole review
Statistical Analysis Plan
Data review (before unblinding)
Programmation SAS
Production, interprétation et présentation des résultats
Clinical Study Report
Support statistique pour de nombreux services Recherche et Pré-clinique

Détails de l'expérience

Ses 18 mois de CDD au sein de ses deux services m'a permis de découvrir puis d'apprendre l'industrie pharmaceutique à partir de la création de la molécule jusqu'à sa première étude chez l'Homme pour tester son efficacité clinique
Au sein de la pré-clinique, j'ai pu apprendre les règles ICH et les formats SDTM et ADaM. J'ai pu perfectionner ma connaissance SAS et apprendre le reporting avec SAS
Au sein de la Recherche, j'ai retrouvé en partie la Recherche Universitaire où les questions n'ont pas forcément de réponses, mais plutôt des hypothèses plus ou moins probable. Ces hypothèses étant formulées grâce à la fouille de données

Modélisation des grandes Naïades de France (données "presence-only") dans le but de découvrir des habitats favorables non colonisé par l'espèce, dans un objectif de conservation.
Co-auteur d'un article scientifique : French naiad (Bivalvia: Margaritiferidae, Unionidae) species distribution models: prediction maps as tools for conservation
Prié, V., Molina, Q. & Gamboa, B. Hydrobiologia (2014) 735: 81. doi:10.1007/s10750-013-1597-3
Réalisation des analyses statistiques de différents projets (autoroutes, LGV, gestion d'accotement de voirie, ...).
Participation à la rédaction d'études d'impacts, d'études d'incidences, appels d'offres, ...
Support statistique et modélisation pour plusieurs chefs de projets.
Création d'interfaces "clic-boutton" permettant à un utilisateur ne connaissant ni R, ni les statistiques de réaliser des techniques simples.
Réalisation de nombreuses fiches PDF via l'interaction entre R, Excel, LaTeX.

Détails de l'expérience

Durant cette expérience professionnel j'ai pu me former plus intensément au langage LaTeX avec pour finalité la production de fiches espèces. Ces fiches partagent la même forme, seul le fond change. Les informations variant entre chaque fiche, elles furent stockées au format Excel, puis lues et intégrées dans les fiches PDF directement, grâce à R.
Afin de proposer les interfaces "clic-boutton" à des utilisateurs sans connaissances en statistiques aucune violation des prérequis statistiques ne doit être possible. En ce sens, toutes les sécurités sont codés. Ainsi, l'utilisateur n'a pas la possibilité de mettre en oeuvre une technique statistique qui ne serait pas acceptable.
Quelques études réalisées :
- Localisation estimée des noyaux de populations de différentes espèces d'oiseaux (IPA, krigeage, lecture et création de shape par R).
- La mise en place de dallots favorise-t-il le franchissement de la faune aquatique (protocole BACI).
- Création automatique d'un tableau excel mis en forme, pour chaque SIC et chaque ZPS française grâce aux bases de données libres (INPN).
- Analyse des relations entre différents types de bassins autoroutiers et des traits de vie de la faune y résidant (AFC, dendrogramme).
Formation interne à QGIS.

Description de l'entreprise

Le bureau d'étude Biotope est spécialisé dans la gestion de la biodiversité et l'ingénierie environnementale.

Interprétation de questionnaires au sujet de l'orientation scolaire via les tris à plat, les tris croisés et tests de Khi².
Interrogation et utilisation de plusieurs bases de données Access par R (package RODBC).
Création, mise à jour, mise en forme (couleur de fond, de police, largeur de colonne) de nombreux tableaux Excel automatiquement grâce à R et au package xlsx.

Détails de l'expérience

Utilisation du package RODBC de R afin d'utiliser une base de données Access et du package xlsx pour d'autres fichiers Excel, directement à partir de R.
Ce travail sur des données qualitatives m'a permis d'améliorer mes compétences sur ce type de données, et de m'approprier le package RODBC.
Création d'une interface "clic-bouton" via R (package tcltk) permettant de réaliser les tris à plats, les tris croisés et les tests de Khi² par un utilisateur ne connaissant ni R ni les statistiques.

Description de l'entreprise

UDAF : Union Départementale des Associations Familiales

Continuité du stage de fin d'étude.
Modélisation statistique, production de résultats pertinents, optimisation de scripts.

Détails de l'expérience

Ce CDD s'inscrit dans la continuité de mon stage de fin d'étude. Outre la production de résultats complémentaires, j'ai optimisé des simulations dans le but de réduire significativement le temps de calcul.
Ce CDD s'est déroulé au sein du bureau d'étude Biotope (et non au laboratoire EDB, comme mon stage de fin d'étude), ce qui m'a permis de côtoyer quotidiennement les différents acteurs du projet Explore 2070.

Description de l'entreprise

Le bureau d'étude Biotope est spécialisé dans la gestion de la biodiversité et l'ingénierie environnementale.

Site web de l'entreprise

http://www.biotope.fr/

Modélisation statistique de la répartition de l'habitat favorable de 38 espèces de poisson d'eau douce sous forçage climatique à l'horizon 2070.
Les projections des répartitions actuelles et futures ont permis d'évaluer la vulnérabilité de ces espèces sous hypothèse de changement climatique.
Ce stage a été réalisé dans le cadre du projet "Explore 2070", financé par le Ministère de l'Écologie, du Développement durable, des Transports et du Logement.
Ce stage s'est conclu par l'obtention d'une mention Bien à mon master 2.

Détails de l'expérience

La modélisation, les projections et les divers résultats sont produits via le logiciel R.
Les représentations cartographiques sont quant à elles produites par le logiciel ArcGIS.
Ce stage s'est déroulé au sein du laboratoire EDB (Evolution et Diversité Biologique de Toulouse) sous la tutelle de Gaël Grenouillet.
Une telle délocalisation m'a permis de consolider ma faculté au travail avec plusieurs interlocuteurs. De plus des présentations de la méthodologie et des résultats produits furent organisés lors de réunions de travail regroupant différents organismes (Biotope, EDB, ONEMA).
Ce stage m'a énormément appris autant du point de vue biostatistique (consolidation de mes connaissances et découverte de nouvelles approches et techniques), que de l'attrait pour le métier de biostatisticien.

Description de l'entreprise

Le bureau d'étude Biotope est spécialisé dans la gestion de la biodiversité et l'ingénierie environnementale.

Étude de l'impact des rejets thermiques de la centrale nucléaire de Golfech (82400) sur les assemblages de poisson et leur abondance.
Étude de la mortalité au volant suivant plusieurs critères et leurs interactions (état de la route, ivresse, état des pneus, port ou non de la ceinture de sécurité ...) basé sur l'élaboration de plans d'expériences.
Analyse temporelle de l'abondance de larves de poissons au sein de la rivière des Perles (Pearl River) en Chine en relation avec le débit perturbé par un barrage hydro-électrique.
Étude de la relation entretenue entre l'activité solaire et les cycles pluriannuels (séries temporelles) des températures au niveau de l'Antarctique.
Étude de la structure des communautés de poissons et modélisation de la distribution de la truite de rivière en France.
Étude de la relation entretenue entre un "indice globale de vulnérabilité" et le rapport masse du cerveau/masse du corps dans le cas de 62 espèces de mammifères.

Détails de l'expérience

Centrale nucléaire de Golfech :
Les stations les plus proches des rejets thermiques sont ressortis comme ayant des assemblages de poissons significativement différents des stations peu à non affectées par ces rejets thermiques.
Étude menée sur des abondance via les techniques et indices suivants : Indice de similarité de Jaccard, Indice de dominance de Berger-Parker, Indice de diversité de Shannon, Richesse spécifique, AFC, ACC, RF, CART, test de Mann-Whitney.
Projet réalisé sous R.
Mortalité au volant :
Recherche des facteurs et des interactions les plus influents dans la mortalité au volant.
Projet réalisé sous Minitab.
Pearl river :
Les principales conclusions de ce projet ont montrées que l'abondance de larves de poisson est positivement corrélée avec le débit. Une cyclicité annuelle est apparue correspondant à la période de fraie des poissons. Par ailleurs une cyclicité pluri-annuelle (séries temporelles) fut mise en avant du fait de la position dans le réseau hydrographique de 2 des 4 zones de fraies de la Pearl River en amont du barrage, qui correspond aux périodes d'ouverture du barrage.
Projet réalisé sous Scilab.
Activité solaire :
Caractérisation des cycles d'activité solaire, des cycles des températures au niveau de l'Antarctique, et mise en évidence des relations entretenues entre les deux (séries temporelles).
Projet réalisé sous Scilab.
Communautés de poissons :
La structure des communautés de poisson en France est apparue particulièrement sensible à la température annuelle et à la température du mois le plus chaud, ce qui se comprend du fait de la poïkilothermie des poissons, leur température corporelle suivant la température de l'eau.
La modélisation de la truite fut effectuée par deux GLM, un sur les données de présence-absence et un sur les données abondances permettant de répondre respectivement aux questions suivante : (i) la truite arrive-t-elle à survivre et (ii) la truite parvient-elle à survivre ET à se reproduire ?
De plus la modélisation (GLM) de la truite de rivière (amont), le goujon (intermédiaire) et le gardon (aval) fut réalisée afin de représenter la zonation de Huet.
Projet réalisé sous R.
Mammifères :
Le rapport masse du cerveau/masse du corps fut interprété comme une indication d'une relative intelligence.
Ce projet a mis en évidence l'existence d'une relation négative entre cet indice et ce rapport, traduisant une diminution de la vulnérabilité lorsque le rapport augmente.
Projet réalisé sous R.

Accueil des Urgences, consistant à la création du dossier médical du patient sur le logiciel AS-400, de son accueil et d'un pré-diagnostique. Des tâches administratives accompagnent ce travail.
Standard téléphonique, consistant à orienter les multiples appels entrants et sortants, ainsi que l'appel des différentes équipes d'astreinte.

Détails de l'expérience

L'accueil, qu'il soit téléphonique ou non, des patients et de leur entourage est particulièrement intéressant du fait de leur relative (ou non) détresse, me permettant ainsi de leur porter secours. Ce fut une expérience particulièrement intéressante qui m'a beaucoup apporté autant pour mon relationnel client que pour la découverte du travail de nuit.

Employé SAV, consistant à accueillir le client et réussir à résoudre son problème le plus efficacement possible (logiciel : AS-400).
Magasinier comptoir, consistant à apporter au client son produit le plus rapidement possible tout en établissant un bref contact avec celui-ci.
Magasinier réserve (déchargement, pointage et rangement des produits pour le stock).
Livreur occasionnel de gros électroménagers à domicile ainsi que de leur installation.

Détails de l'expérience

Ce poste assez varié a consolidé mon relationnel client et mon attrait pour la vie active.

Agent de circulation.
Ponçage d'une passerelle en béton.

Creuser une tranchée à la pelle afin de tendre un câble de fibre optique (EDF).
Serveur à l'occasion d'un mariage.
Employé d’une entreprise de nettoyage après feu et inondation (AAD Phoenix).
Remplisseur de bouteille propane et butane (Total gaz).

Détails de l'expérience

Ces deux mois d'intérim m'ont permis de découvrir de nombreux métiers appartenant à différents secteurs d'activités, enrichissant mon expérience professionnelle.

Serveur à l'occasion de la féria de Rieumes (31370).

Détails de l'expérience

Une expérience intéressante m'inculquant le relationnel client, la résolution de conflits mineurs ainsi que le travail sous stress.

Installation et désinstallation de matériel électrique.
Mise en place de chapiteaux, de guirlandes électrique et logistique de ces différents matériels.

Détails de l'expérience

Ce contrat a été pour moi le premier contact avec la vie active.

Création et ré-actualisation de sites internet

Détails de l'expérience

Un intérêt pour le langage html m'a dirigé vers cette mission, m'apportant une certaine expérience dans ce domaine.

Your browser is outdated!

Biostatisticien

Biostatisticien préclinique

Biostatisticien préclinique

Biostatisticien

Chef de projet - Biostatistique

Chargé d'études statistiques

Chef de projet - Biostatistique

Biostatisticien - Stage de fin d'étude

Projets étudiant

Veilleur de nuit à l'accueil des Urgences ou au standard téléphonique

Magasinier comptoir et service après vente

Intérim

Différents postes d'intérim

Serveur

Vacataire au service des fêtes de la mairie de Muret.

Création et ré-actualisation de sites internet.