Développement d’un progiciel de post-traitement d’images IRM à destination de la Recherche en Cancérologie.
Détails de l'expérience
Analyses et implémentation des algorithmes de post traitement IRM • Sélection des Algorithmes de Post-traitement de données IRM applicable au projet • Mise en place du visuel et de la fonctionnalité de l’interface utilisateur • Création d’un Protocole IRM en adéquation avec les algorithmes utilisés
Validation des algorithmes implémentés • Induction des masses tumorales par injection In Vivo de cellules cancéreuses • Validation des Algorithmes implémentés par expériences sur tube In Vitro • Validation des Algorithmes implémentés sur l’animal In Vivo • Comparaison des résultats expérimentaux avec les résultats obtenus dans la bibliographie
Evaluation Globale d’utilisation du Progiciel & finalisation du développement • Rédaction du Manuel utilisateur • Amélioration de l’interface utilisateur • Formation sur l’utilisation du Progiciel • Correction de Bugs • Ajouts de nouvelles fonctionnalités pour la publication d’image IRM
Développement & optimisation de méthodes et protocoles HTP pour la plateforme robotique.
Détails de l'expérience
Projets développement : Optimisation de méthodes de production et de caractérisation • Développement d’un milieu de culture Bactérien Auto-Induit. Optimisation des conditions de cultures • Développement d’un protocole de purification protéique HTP Optimisation sur Robot TECAN
Projets analytiques : Développement de méthodes analytiques HTP • Développement d’une méthode d’analyse HTP du pH par spectrophotométrie Mise en place du procédé technique Rédaction du protocole et du Template expérimentale (Excel) • Développement d’un protocole de SDS-PAGE Automatisables sur plateforme Robotique Rédaction des documents (protocole utilisateur, script FluentControl®) Reporting et formation des équipes
Activités Annexes : • Support Robotique (Miniprep, dosage BCA, purifications, culture bactérienne) • Gestion des consommables et du Laboratoire • Formation à l’utilisation de la plateforme • Gestion des stocks et de la maintenance
Plateforme robotique composée de plus de 15 automates permettant le développement & l’optimisation de plusieurs méthodes de Biologie synthétique, Microbiologie & Biologie moléculaire à haut débit.
Détails de l'expérience
Développement méthodes de Biologie moléculaire automatisées à haut débit : • Optimisation et miniaturisation de protocoles manuels pour l’automatisation • Développement de protocoles automatisés sur différents supports robotiques (Beckman®, Dynamic Device®, Integra®) • Optimisation de protocoles à haut débit de cultures et suivis de croissances de Levures et Bactéries. • Développement de procédures automatisées d’extraction d’ADNg, plasmides et ARN (Macherey Nagel, Quiagen, Beckman) • Optimisation des protocoles de préparation de banque NGS (Illumina & Nanopore)
Validation d’une application de gestion des consignations (CoSaRep) : • Sourcing fournisseurs et prospection de nouvelles technologies d’automatisation • Rédaction et mise à jour des procédures et mode opératoire (SOP & Manuel Utilisateur) • Participation à la gestion et mise en place des démarches de gestion des déchets biologiques et chimiques de la plateforme robotique • Maintenance et entretien du parc d’équipements.
Activités Annexes : CAO / Impressions 3D / Gestion • Conception et modélisation de pièces de laboratoire à destination de la paillasse ou des robots • Manuel d’utilisation et standardisation de l’utilisation et du paramétrage de l’imprimante • Entretien du laboratoire et gestion des consommables • Formation des collaborateurs aux nouvelles procédures
Mise au point d’une technique de quantification d’ARNm cible par Hybridation In Situ Fluorescente en microscopie confocale, pour des projets de cosmétique.
Détails de l'expérience
Mise en place du protocole • Analyse du protocole technique fourni • Culture Cellulaire Sélection des types cellulaire d’intérêt cosmétique • Rédaction du Protocole spécifique au type cellulaire sélectionné • Mise en Application du protocole et correction
Validation du protocole pour projet cosmétique • Application du protocole sur ARNm d’intérêts cosmétique • Validation des résultats obtenus par techniques de Biologie Moléculaire conventionnelles • Rédaction du Manuel Technique
Caractérisation d’un système d’expression de la luciférase (Bioluminescence) contrôlée par la présence d’ARN d’intérêts. Le système est exprimé par des cellules de glioblastome après transfection virale.
Détails de l'expérience
Evaluation quantitative du système d’expression • Quantification de la Bioluminescence émise selon les conditions de transfection • Quantification par qRT-PCR des ARNm codant l’expression de la protéine bioluminescente • Quantification des transcrits par qPCR
Validation de l’expression par techniques de Biologie Moléculaire. • Sélection des conditions de transfections les plus efficaces • Validation de l’expression de Bioluminescence par Western Blot • Expérimentation du système d’expression sous contrôle de molécules naturel d’intérêts cosmétique
Détection d’un type de cancer du pancréas par IRM. Caractérisation de différents agents de contrastes responsif au zinc.
Détails de l'expérience
Phase d’induction de la cancérisation et suivi animal • IRM de contrôle des animaux • Injection des cellules cancéreuses dans le Pancréas des animaux • Analyse IRM In Vitro de l’agent de contraste selon les conditions d’expérimentation
Intitulé de la mission 2 Analyse de l’évolution du cancer par IRM et agent de contraste spécifique • Suivis par IRM de l’évolution tumorale ainsi que des constantes vitales des animaux • Injection de l’agent de contraste à différents stades de l’évolution tumorale
Caractérisation de l’efficacité de détection de l’agent contraste par dissection et Spectroscopie ICP-OES. • Mesure des masses cancéreuses par dissection tous les sept jours • Comparaison des mesures directes et des mesures IRM • Validation de l’efficacité de détection de l’agent de contraste sur protocole d’imagerie standard • Caractérisation In Vivo de l’environnement optimale de visualisation de l’agent de contraste