José Viñuelas
Biologiste Moléculaire (PhD)
45 ans
Permis de conduire
Lyon (69006) France
Situation professionnelle
En poste
En recherche active
Présentation
De formation Docteur / Ingénieur INSA, j'ai acquis au cours de mes différentes missions une expertise en biologie moléculaire et cellulaire, et plus précisément dans le contrôle de l'expression des gènes.
Aujourd'hui, mon projet professionnel est d'intégrer un poste de scientifique / ingénieur R&D, en Recherche et Développement, dans le domaine des biotechnologies / de l'industrie pharmaceutique, en biologie moléculaire et cellulaire.
Aujourd'hui, mon projet professionnel est d'intégrer un poste de scientifique / ingénieur R&D, en Recherche et Développement, dans le domaine des biotechnologies / de l'industrie pharmaceutique, en biologie moléculaire et cellulaire.
Scientifique confirmé en biologie moléculaire et biologie de synthèse
INSA - Institut NAtional des Sciences Appliquées de Lyon
Depuis mars 2014
CDD
Lyon
France
- Projet : Modification et optimisation de souches bactériennes et lignées cellulaires pour la synthèse de molécules d'intérêt pharmaceutique
Détails de l'expérience
- Conception de vecteurs d'expression
- Optimisation de lignée cellulaires
- Mise en place d'une plateforme de biologie de synthèse
- Optimisation de souches bactériennes
- Création d'une chaire d'entreprise en ingénierie métabolique (en cours)
Scientifique confirmé en biologie moléculaire et cellulaire
CNRS - Centre National de la recherche scientifique
Décembre 2008
à janvier 2012
CDD
Lyon
- Projet : "Etude de l'impact de l'environnement génomique et chromatinien sur la variabilité de l'expression génique, dans des cellules eucaryotes supérieurs aviaires et humaines."
Résultats : 5 articles publiés, 1 en cours de publication - 6 communications orales et affichées
Détails de l'expérience
- Caractérisation, par cytométrie en flux, de la variabilité de l'expression génique au sein de clones cellulaires exprimant stablement un rapporteur fluorescent. Identification des sites d'insertion génomiques de transposons par splinkerette PCR couplée à un séquençage haut débit nouvelle génération de type 454.
- Étude des relations entre la variabilité intraclonale de l'expression de transgènes et l'état chromatinien globale de la cellule en condition "naturelle", et après modification de l'état de compaction de la chromatine.
- Interprétation des données biologiques par simulations de type "Monte Carlo" d'un modèle stochastique de l'expression des gènes prenant en compte la dynamique chromatinienne à l'échelle du promoteur.
- Analyse, à large échelle, des relations entre l'environnement génomique d'un transgène, stablement intégré dans une cellule, et son expression stochastique.
- Étude par vidéo-microscopie de la cinétique du profil d'expression d'un gène rapporteur dans des cellules individualisées. (Collaboration équipe A. Paldi, Généthon, France)
Scientifique junior en biologie moléculaire et génomique fonctionnelle
INRA - Institut national de la recherche agronomique
Octobre 2005
à novembre 2008
CDD
Lyon
- Projet : "Etude des capacités de régulation génétique d'une bactérie modèle à génome réduit (Buchnera aphidicola) dans un système symbiotique obligatoire."
Résultats : 6 articles publiés - 14 communications orales et affichées
Détails de l'expérience
- Caractérisation de l’organisation en opérons des gènes, et analyse par puce à ADN des relations entre le niveau d'expression des gènes (transcriptome) et l'organisation du chromosome de la bactérie.
- Quantification de la réplication plasmidique et de la régulation transcriptionnelle de la bactérie, respectivement par PCR et RT-PCR quantitatives, suite à un stress trophique appliqué aux cellules hôtes (cellules d’insecte).
- Analyse du transcriptome de la bactérie au cours du développement embryonnaire de son hôte (collaboration équipe Tom Wilkinson, University College Dublin, Irlande).
Stage de Recherche
ESRF - European Radiation Synchrotron Facility
Avril 2002
à août 2002
Stage
Grenoble
- Projet : "Etude structurale protéique de la bactérie radiorésistante Deinococcus radiodurans."
Détails de l'expérience
- Sur-expression et purification par chromatographie d'affinité de la protéine "GGDEF" codée par le gène DRA 0297, de la bactérie Deinococcus radiodurans, en vue de la cristalliser.
