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Jean-Michel Mugnes

Développeur scientifique

Québec Canada (Québec)
Situation professionnelle
En poste
Ouvert aux opportunités
Présentation
Pluri-disciplinaire et polyvalent par essence, je prends plaisir à résoudre des problèmes de natures et de complexités variées.

Que ce soit pour un télescope, un microscope, des instruments à bord d'un satellite ou encore des logiciels industriels, j'aime trouver des solutions qui rapprochent les utilisateurs de leurs données ou de leurs produits afin qu'ils puissent se consacrer à
l'essentiel et prendre du plaisir à travailler.

Pour en savoir plus sur me réalisations, n'hésitez pas à consulter mon cv en ligne (https://www.doyoubuzz.com/jean-michelmugnes)
ou mon profil Linkedin (https://www.linkedin.com/in/jean-michel-mugnes)
  • Développement complet d'un logiciel de composition de mosaïque d'images de caméra hyperspectrale. Incluant, l'architecture, les tests unitaires, outils de builds et la maintenance.
  • Création d'un framework modulaire de calcul de transfert radiatif pour des applications, allant de l'étude de marché à la livraison d'un module d'analyse hyperspectral.
  • Design et implémentation d'algorithmes de détection dans des images hyperspectrales.
  • Implémentation d'algorithme d'optimisation non linéaires.
  • Support pour la traduction de code prototypé (en Matlab) vers du code de production (en C++)
  • Support pour la traduction de code Matlab vers Python
  • Rédaction et vérification de documentation (manuel d'utilisateurs, documentation de code, etc...)
  • Inciter et aider à l'instauration de bonne pratiques de programmations: linting, unit tests, clean code, etc...
En savoir +
  • Mandaté chez Optel en tant que consultant python.
  • Travail en équipe dans un contexte Agile et de production.
  • Lead partagé de l'équipe de production
  • Développement de logiciels internes facilitant le déploiement des produits numériques de sérialisation du client.
  • Développement d'un framework de tests d'intégrations
  • Développement de logiciels d'installation et de configuration des produits du client
  • Utilisation et implémentation de composante ETL (Extract Transform Load)
  • Participation aux efforts d'intégration continue
  • Rédaction de documentation complète indiquant l'installation et l'usage du code source, ainsi que l'usage des logiciel
  • Formation d'employés à la programmation
  • Manipulation et récupération de base de données
  • Support techniques interne et externe
  • Diplôme Lean Six-Sigma niveau White belt
  • Plus précisément employé au sein du centre de recherche, par le Laboratoire de Recherche en Neurophotonique et Psychiatrie dirigé par Pierre Marquet titulaire de la chaire d'excellence en Neurophotonique
  • Développement d'analyses scientifiques et techniques allant de l'estimation de performance du matériel, à l'analyse des propriétés cellulaires, en passant par l'ajustement de modèles théoriques aux données expérimentales.
  • Participation au projet Sentinelle Nord (sous-projet 2.4)
  • Conception et mise en place d'un «pipeline» de traitement d'images biologiques, faisant appel à des techniques d'analyse d'images automatique, de transfert de serveur à serveur, d’exécution de tâches sur un super-calculateur, d'optimisation d'espace et de procédés, ainsi qu'à une bonne gestion des données.
  • Développement d'applications avec interfaces graphiques pour les usagers du pipeline permettant: le paramétrage des différents traitements, la préparation et la visualisation des données brutes, la vérification de la qualité des données traitées, ainsi que l'extraction des résultats et mesures effectuées en cours de traitement.
  • Formation des étudiants et des professionnels de recherche à l'utilisation des logiciels professionnels et «faits maison» ainsi que des principes mathématiques/statistiques impliqués.
  • Organisation et standardisation des données de recherche dans le but de d'améliorer l'inter-opérabilité et l'efficacité du laboratoire, de faciliter le stockage et le transfert des données, ainsi que de simplifier leur exportation vers une base de données multi-disciplinaire.
  • Rédaction de manuels de fonctionnement, de tutoriels d'utilisation et d'articles scientifiques.
  • À propos du pipeline de traitement d'images:

    Il devait remplir plusieurs objectifs:

    • Être assez robuste pour pouvoir traiter efficacement des To de données très variées .
    • Être assez flexible pour permettre l'incorporation de nouveaux traitements ou toute nouvelle combinaison de ceux existants.
    • Être simple d'utilisation pour les usagers et avec un nombre limité de règles à respecter quant à la préparation des données.
    • Être simple à gérer: Les taches de transfert vers le serveur distant, l’exécution des tâches, et la vérification du bon avancement de chacune des étapes de traitement se résument à 3-4 lignes de commandes.
      .
  • À propos des applications développées:

    Elle doivent également remplir plusieurs objectifs:

    • Être simple d'utilisation.
    • Être fiable.
    • Permettre une certaine flexibilité quant à leur utilisation.
    • Être documentées.
    • Être facile à installer sur n'importe quel poste.
    • Produire des journaux d'utilisation (logbooks) facilitant le débogage et la maintenance.
  • Gestion de projet: conception, organisation, mise en œuvre, synthèse, et présentation
  • Programmation, analyse et optimisation de code
  • Traitement du signal : acquisition, réduction et analyse de données
  • Analyses statistiques classique et bayésienne
  • Modélisation d'atmosphère stellaire
  • Transport, installation et utilisation d'instruments de haute technologie
  • Communications orales et écrites en français et en anglais
  • Étude de la microturbulence dans les régions actives du Soleil
  • Développement d’un outil interactif avec interface graphique pour le traitement et l’analyse des données du spectrographe UV SUMER à bord du satellite solaire SOHO
  • Extrait de la lettre de recommandation du Docteur Patrick Boumier, Directeur de mon premier stage à l'IAS qui m'a, par la suite,engagé comme développeur de logiciel afin de compléter et de perfectionner le travail effectué lors du stage:

    "Je fus le Directeur du stage de Jean-Michel Mugnes, au niveau Master1, dont le but était l’analyse des variations temporelles des propriétés sismiques du Soleil. Excepté par l'observation (délicate) des neutrinos solaires, l'intérieur du Soleil ne nous est accessible que via l'étude des modes propres de vibration de l'étoile, d’où l’importance de la discipline associée : l’Héliosismologie. Le travail de J.M. Mugnes confirme la corrélation entre les propriétés sismiques du Soleil et son cycle d’activité magnétique.

    Au cours des 3 mois de travail, J.M. Mugnes a montré une réelle aptitude à comprendre les problèmes posés, à proposer des pistes de solution, et ce cadré par un très bon esprit critique. De plus, J.M. Mugnes utilise l’outil informatique sans aucune difficulté. J.M. Mugnes a écrit plusieurs programmes sous forme de widgets (interfaces conviviales et puissantes) qui se concrétisent par des outils exploitables par autrui. Un manuel d’utilisation très clair permet de plus de pouvoir adapter l’analyse à des données de format différents (échantillonnage temporel…).

    Fort de ces certitudes, j’ai confié à J.M. Mugnes la réalisation d’outils dédiés à l’analyse des modes d’oscillation solaires de basse fréquence, qui sondent les couches les plus profondes de l’étoile. Ce travail de longue haleine est en cours.[...]

    Patrick Boumier

    Équipe de Physique Solaire et Stellaire
    IAS Orsay / CNRS "
  • Développement d’un outil interactif avec interface graphique pour le traitement et l’analyse des données de l’instrument GOLF à bord du satellite solaire SOHO
  • Étude des propriétés sismiques du Soleil (oscillations de mode-g) en utilisant les données de l’instrument GOLF à bord du satellite solaire SOHO
  • Écriture du scénario
  • Coordination des différents laboratoires
  • Conception et animation de la présentation principale et de l’expérience d’astrophysique
  • Écriture du scénario
  • Conception de la configuration du kiosque
  • Cet événement était organisé par Attraction Chimique et s’est déroulé dans le cadre d’une exposition scientifique grand public dans la ville de Québec.
  • Pour résoudre une enquête criminelle fictive et amusante, les participants doivent entreprendre plusieurs expériences scientifiques (identification d’ADN, d’empreintes digitales et d’encres de stylo).

Doctorat en astrophysique

Université Laval, Québec, Canada

2008 à 2017
Titre de la thèse:
« La statistique bayésienne comme un nouvel outil pour l’analyse spectrale: Détermination des paramètres fondamentaux, de la métallicité, et des abondances chimiques des étoiles massives. »

En bref:
  • Mise au point et application d'une méthode d'analyse multi-paramétrique originale des spectres stellaires
  • Développement d'une suite de programmes informatiques permettant d'effectuer l'analyse de façon simplifiée et automatique

Master de physique fondamentale et expérimentale spécialisation atomes et molécules

Université Paris VI/ Université Paris-Sud XI, France

2006 à 2008
Formation généraliste de physique théorique et pratique avec un accent sur la mécanique quantique et la spectroscopie.

Licence de physique fondamentale

Université Paris-Sud XI, Orsay, France

2001 à 2006
  • Programmation scientifique
    Avancé
  • Développement Logiciel
    Avancé
  • Physique fondamentale
    Avancé
  • Spectroscopie
    Avancé
  • Traitement du signal
    Avancé
  • Statistiques
    Avancé
  • Analyse d'image
    Avancé
  • Instrumentation
    Bon niveau
  • Optique
    Bon niveau
  • Apprenant
    Expert
  • Communicateur
    Avancé
  • Analytique
    Avancé
  • Polyvalent
    Avancé
  • Multitâche
    Avancé
  • Formateur
    Avancé
  • Anglophone
    Avancé
  • Python
    Expert
  • Matlab
    Bon niveau
  • IDL (équivalent Matlab)
    Bon niveau
  • C++
    Intermédiaire
  • Bash, batch
    Intermédiaire
  • XML
    Intermédiaire
  • SQL
    Intermédiaire
  • Fortran
    Intermédiaire
  • Labview
    Notions
  • Pascal, Delphi
    Notions
  • Programmation: Pycharm, Matlab, Visual Studio, IDLDE
    Avancé
  • Projet et Production: Jira, Redmine, Jenkins, Gitlab
    Bon niveau
  • Versionnage: Git, Github, Gitlab
    Bon niveau
  • Bureautique: PowerPoint, Word, Excel, Libreoffice, Google docs
    Avancé
  • Documentation: LATEX, Confluence, Sphinx
    Avancé
  • Productivité: Teams, Slack, Google drive
    Bon niveau
  • Traitement d'images: CellProfiler, Fiji
    Bon niveau
  • Connectivité: Putty, MobaXterm, ssh
    Bon niveau
  • Graphique: Gimp, Adobe Illustrator, Inkscape
    Bon niveau
  • Conteneur: Docker, Azur, Ansible
    Notions
  • Windows
    Avancé
  • Linux
    Avancé
  • iOS
    Bon niveau
  • Dessin digital photoréaliste, bricolage
  • Dévoreur de manga, de fantasy et de science-fiction
  • Ceinture orange de Karaté Shotokan