Eric Charpentier
Bioinformaticien
43 ans
Permis de conduire
Nantes (44000) France
En poste
Ouvert aux opportunités
Compétences
Bioinformatique
-
Analyse de puces de génotypage
Axiom
-
Analyse de données de séquençage haut-débit
Exomes, Whole genome, RNA-seq, RNA-seq 3'
- Analyse de puces aCGH
- Utilisation/Administration/Intégration d'outils Galaxy
-
Création de pipelines bioinformatiques
Snakemake
-
Utilisation des outils de contrôle de version de code
git
-
Utilisation des clusters de calcul
SGE, Ligne de commande linux
-
Formateur aux bonnes pratiques de développement
Données FAIR, Jupyter notebooks, Docker, Git, Conda
Programmation
- Java, python, R, bash
-
Création d'interfaces web
JSF, Primefaces, GWT, SmartGWT, Spring Framework, Hibernate, perl CGI
-
Base de données
MySQL
-
Création de pipelines d'analyse
Snakemake, git, markdown, R