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deborah merda

Génomique, bio-informatique

deborah merda
39 ans
Permis de conduire
Montluçon (03100) France
Situation professionnelle
En poste
Indisponible
CV réalisé sur DoYouBuzz
  • Etude des entérotoxines staphylococciques
  • Typage des souches de Staphylococcus aureus
  • Participation à des groupes de travail européens
  • Norme ISO 17025
En savoir +

Histoire évolutive et patho-adaptation de Xanthomonas arboricola : études génomique et phénotypique comparées de souches phytopathogènes et commensales

INRA, IRHS, équipe EMERSYS, encadré par M-A. Jacques et M. Fischer-Le Saux
Novembre 2013 à octobre 2016
CDD
Angers
France
  • Doctorat
  • bio-informatique
  • phylogénomique
  • génomique comparative
  • génomique des populations
  • phénotypage bactérien
  • statistiques
  • encadrement de stagiaire (niveau M1)

Approches combinées pour reconstruire l'histoire évolutive du genre Biscutella (Brassicaceae) : Phylogénétique, génomique et étude de la diversité allélique au locus d'auto-incompatibilité

CNRS, GEPV, équipe Ecologie, Evolution et Génomique de l'auto-incompatibilité, encadré par X. Vekemans et C. Poux
Janvier 2013 à juin 2013
Stage
Lille
France
  • PCR
  • SSCP
  • Séquençage
  • clonage
  • analyse de séquences d'ADN
  • phylogénie

Dynamique de contact secondaire entre deux populations divergentes d'un pathogène fongique, Venturia inaequalis

INRA, IRHS, équipe EcoFun, encadré par T. Leroy, C. Lemaire et B. Le Cam
Avril 2012 à juin 2012
Stage
Angers
France
  • PCR
  • Isolements monospores
  • extraction d'ADN
  • microsatellites
  • génétique des populations

Doctorat

Université d'Angers

Novembre 2013 à octobre 2016
Génomique des populations
Thèse soutenue publiquement le 29 Novembre 2016

Master 2 Recherche

USTL Lille 1

2011 à 2013
Ecologie et Environnement mention gestion et evolution de la biodiversité

Licence

Université d'Angers

2008 à 2011
Sciences du Vivant et Géosciences, parcours Biologie des organismes et des populations
  • Macori G. et al. (2019) Genome-Wide Profiling of Enterotoxigenic Staphylococcus aureus Strains Used for the Production of Naturally Contaminated Cheeses. Genes
  • Merda D. et al. (2017) Ancestral acquisitions, gene flow and multiple evolutionary trajectories of the type three secretion system and effectors in Xanthomonas plant pathogens. Mol Ecol
  • Merda D. et al. (2016) Recombination-prone bacterial strains form a reservoir from which epidemic clones emerge in agroecosystems. EMIR.
  • Depuis 2014: 13 présentations orales
  • Depuis 2014: 5 présentations affichées
  • Anglais
    lu, écrit, parlé
  • Italien
    lu, écrit, parlé