Ingénieur de recherche @ CNRS - UMR 7357 (ICUBE)

Fort de plusieurs expériences dans le domaine de la recherche informatique et la réalité augmentée appliquée au monde médical. J'ai acquis des compétences en développement C++, plus particulièrement sur les bibliothèques ITK et VTK ainsi que Qt.
Je participe à plusieurs projets open-source : BTK qui est une suite d'utilitaires permettant l'étude de la maturation cérébrale chez le foetus. Et plus récemment FW4SPL qui est un framework orienté composants s'intéressant aux problématiques de visualisation et traitement des images médicales, et aussi de réalité augmentée en bloc opératoire.

Dynamique et curieux je dispose d'une grande capacité d'adaptation et d'une grande autonomie.

Expériences

Développement logiciel en C++ avec ITK
Optimisation et maintenance du toolkit BTK
Étude de la maturation cérébrale des fœtus
Encadrement d'un stage sur l'extraction automatique des cerveaux sur image IRM
Recalage et correction de mouvement

Détails de l'expérience

Le but des études relatives à la maturation du cerveau est l’approfondissement de notre compréhension du développement du cerveau et des liens entre les modifications cérébrales et le développement cognitif. Ce type d'étude est fondamental pour pouvoir proposer une aide au diagnostic efficace et un suivi clinique des pathologies cérébrales (évolution, influence d’un traitement). Des études de grande ampleur ont commencé pour l'analyse du cerveau chez l'enfant et l'adulte. Cependant, la maturation cérébrale chez le fœtus et le nouveau né n'a que peu été étudiée in-vivo. Dans ce contexte, l'imagerie par résonance magnétique (IRM) est un outil fondamental. Chez le foetus, grâce au développement de séquences d'acquisition ultra-rapides, l'IRM permet aujourd’hui d'obtenir des informations complémentaires à l'échographie traditionnelle.
Publications scientifique concernant BTK :
- Y. Taleb, M. Schweitzer, C. Studholme, M. Koob, J.-L. Dietemann, F. Rousseau
  Automatic Template-based Brain Extraction in Fetal MR Images, Human Brain Mapping. Seattle, États-Unis, June 2013
- F. Rousseau, E. Oubel, J. Pontabry, M. Schweitzer, C. Studholme, M. Koob, J.-L. Dietemann
  BTK: An Open-Source Toolkit for Fetal Brain MR Image Processing . Computer Methods and Programs in Biomedicine, pp. 65--73, Vol. 109, Num. 1, doi:10.1016/j.cmpb.2012.08.007 , January 2013 IF: 1.531
  lien :
  http://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00671183/
- J. Pontabry, F. Rousseau, M. Schweitzer, C. Studholme, M. Koob, J.-L. Dietemann
  Longitudinal Probabilistic Atlas of the Fetal Brain, Nouvelles méthodologies en imagerie du vivant. Lyon, France, December 2012

Description de l'entreprise

ICube UMR 7357 - Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie du CNRS (Délégation Régionale Alsace), de l'Université de Strasbourg et de l'Insa de Strasbourg.
C'est un laboratoire interdisciplinaire fédéré par l'imagerie.
Les grandes disciplines qui y sont représentées sont l'Informatique, le Traitement du signal, l'Automatique, la Télédétection.

Site web de l'entreprise

https://github.com/rousseau/fbrain

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Marc Schweitzer

Ingénieur de recherche et développement

Ingénieur de recherche